Saturday, November 26, 2011

Viroloogia

Vaktsiinia viirus(Poxviridae sugukond) on ainus inimese DNA viirus mis replitseerub tsütoplasmas. amööbi Mimiviirus on teine DNA viirus, kes replitseerub tsütoplasmas, ta on nii suur et tal on kõik endal olemas ja tal pole vaja tuuma minna. AGA Phycodnaviirus(rohevetika Chlorella viirus) kes on ka väga väga suur st tal on oma ensüümid ja kõik olemas, aga ikka ta replitseerub tuumas. 
P.S. see rakk on tegelikult metafoor, sest kunagi need kolm viirust ei ole ühes rakus, kõigil on erinev peremees.


Mul tekkis suur vajadus teha ka nukk Chlorella vetika viirus ehk PBCV-1. Ta replitseerib oma dsDNA genoomi, nagu ka ülemisel pildil.


graafik valgete vereliblede ja MHCI suhetest


COP valkude(vesiikuli kattevalgud) tähtis teaduslik skeem. Teised kattevalgud on klatriinid näiteks.


retroviirused vs pararetroviirused 
(pöördtranskriptsiooni etappide erinevused)


Kurjad viirused ja groupied. 
Papillomaviirused ja Polyomaviirused sunnivad rakku jagunema ja vahepeal kogemata nii hullult, et tekib vähk. Adenoviirus sunnib ka rakku jagunema. 
Parvoviirus on eriline DNA viirustest kuna tema ise ei mõjuta rakutsüklit, vaid peab lihtsalt istuma ja ootama millal rakk ise jaguneb või siis kasutab teiste mõjukamate viiruste abi.
Parvoviirust leidub sageli vähis sees, aga tegelikult ta ei tekita seda vaid talle meeldib lihtsalt niiväga olla seal kus toimub piiramatu rakujagunemine, candy mountain. AAV viirus näiteks saab paljuneda ainult siis kui Adenoviirus on abis, et rakku käskida.


Cap-snatching ehk cap-i varastamine ja de-capeerimine ehk Cap-i eemaldamine. Kõik kolm viirust võtavad cap-otsa ära peremehe RNA küljest, aga eri põhjustel.
LA viirus võtab need ära kamoflaažiks ehk et ta ise poleks ainus RNA millel pole capi. ajab niimoodi immuunsüsteemi segadusse.
Gripp ja Bunya varastavad cap ära ja kasutavad seda praimeerimisel. 
Nukleaasid millega lõigatakse - Gripil on PB1, Bunyal L, LA viirusel vist Gag.


et meelde jääks, et puukentsefaliit ja Dengue viirus on +RNA Flaviviirused(kollased ja väga positiivsed),sest see ei jää kunagi meelde. 
p.s. seda võiks tegelikult ka teada et Dengue viirus olemas on ja seda on troopikas (üle 100 miljoni nakkuse igal aastal) ja et kui ühe korra põed elad üle, aga järgmisel korral vöid ära surra phm jooksed verest tühjaks. Ehk siis oskad seda oodata ja võibolla troopikas paned veits rohkem OFFi peale


et meelde jääks -RNA viiruste kohta üks asi, et NEIL on replikatsioon (-RNA--->+RNA--->-RNA) ja transkriptsioon (-RNA---->mRNA) täiesti erinevad asjad.


Shunting mehhanism, valgu sünteesi alustamisel hüppab ribosoom üle teatud ala RNA alguses.

Friday, October 28, 2011

Taimefüsioloogia vol 2

Veel momente taimefüsioloogiast.

Vaheseina moodustumine, fragmoplasti pärssijad Tsütohalasiin B takistab vesiikuline transporti ja Kofeiin takistab fragmoplasti teket ka kuidagi.

 Ühe elektroni transportimiseks on vaja 2 kvanti.

Kloroplasti eri piirkondade (tülakoidi sees oleva ruumi ehk luumeni ja  tülakoidide ümber olev strooma) ja raku sees tsütosooli happesus.

Taime venivuskasv tähendab seda, et rakud paisuvad. Selle tõtu on vaja ka raku kesta muuta elastsemaks ja seda teevad valgud XET ja Ekspansiin kes vastavalt lõikavad tselluloosikihtide vahelt ära glükosiidsidemeid ja vesiniksidemeid.

Õhulõhede sulgemises osaleb ABA(abstsiishape). See on pikem protsess mida ABA teeb, aga lõppkokkuvõttes võib ka öelda, et K+ ioonid lähevad sulgrakust välja ja sulgrakk 'vajub lössi' ja õhulõhe vajub kinni. (Õhulõhe on siis lahti kui sulgrakud lähevad punnis vett täis ja võtavad oma õige kuju)


Mis iooniga ATP energia ülekanne toimub.

Thursday, October 27, 2011

Taimefüsioloogia

See võtab siis nüüd kaua aega, aga alustan varakult :D

Taime kasvu regulaatori etüleeni tegemised. Etüleen on seotud viljade ja lehtede langemisega sügisel, stressivastus vigastuste, külma, kuuma, üleujutuse ja muu puhul. IAA toimel tehakse etüleeni.

Kuidas on valgusega reguleeritud taime kasv. Pimedas seob valk COP fotomorfogeneesi soodustava valgule HY5-le külge valgu nimega ubikvitiini  , mis tähendab seda, et HY5 saadetakse lagundamisse kui pole veel piisavalt valgust, et idaneda või õisi teha. 
Näiteks, et seeme ei hakkaks idanema liiga pimedas, ehk kui ta on maapinnast liiga kaugel, muidu ta ei jõuagi päiksen kasvada ja varuained saavad seemnest otsa. Lisaks et taime ei hakkaks õitsema kui ta on liiga pimedas, ehk pole veel teiste taimede alt välja kasvanud.


Rõhkude valemi portree.
Lihtsalt, et meelde jääks, et  ühe valemi puhul (veepotentsiaal=turgor-osmootne pot) on kaks plussi ja üks miinus. Tegelikult rakus tavaliselt siiski on alati veepotentsiaal negatiivne ja osmootne potentsiaal negatiive, ja ainult  turgorrõhk P on positiivne.
Osmootse rõhu puhul arvutades tuleb kasutada atmosfääre mitte paskaleid.

Sunday, August 14, 2011

Portee maalimine ja sein

Küll on tore vahepeal leida uut muusikat, mis paneb aktiivsemalt tegutsema. Vahepeal saavad kõik laulud otsa ja siis ei olegi eriti tahtmist laua taga istuda. Aga no igaljuhul, ma tegin mõned portreed eile.

Akrüülid, 30x40cm

Lisaks muidu, ma sain oma seina kahesajala ka vist valmis. See silm ei kuulu asja juurde, see on üks teine pilt. Seinapildi tegin ehituspigmentidega, need tavalised pikas potsikus toonerid mida saab ehituspoest. Vesibaasil ka veel, nii et kõik väga lihtne.


Saturday, June 4, 2011

Mu selle suve üheks eesmärgiks on hakata ajulises mõttes paremini suhtuma koertesse. Ma ei soovi koertele halba, lihtsalt ma ei kannata neid eriti. Vahepeal harva nad teevad muidugi midagi talutavat ka, aga mis värk neil selle ülejäänud ajaga on ma ei tea.

Thursday, June 2, 2011

Seina kaheksajalg 1

Sodin oma seina korraks, mõtlesin, et teeks ühe suure lillelise kaheksajala, kes sööb mu ust parajasti, las ta sööb.


1. kaheksajalad on nunnud
2. targad
3. lahedad
4. väga lahedad
5. lemmikud

Vahepeal on nii, et ette joonistades näevad asjad veidi paremad välja (siis on potentsiaali rohkem, sest rohkem saab ette ise kujutada) nii et ma igaks juhuks tegin foto enne kui valmis saab. Kui sassi läheb, siis saab pilti vaadata ja vanu häid aegu meenutada

Hetkel on probleemiks ka see, et värvipoes oleks vaja ära käia. Ma hääletaks selle poolt, et mõni 24/7 tööriistapood võiks küll olla kuskil

Friday, May 27, 2011

lõpeta ära kui kasulik

Õpetlikud joonised geenipraksist ja mikroobifüsioloogiast
(Kusjuures need tegelikult ka aitasid mind)

plasmiid on mõtlik (olgu see joonis eriti ei aidanud geneetika praktikumi mõttes, aga aega aitas küll viita)

bakterite sini-valge testi lühikokkuvõte on, et need kolooniad mis on valged, nendega su katse töötas ja sul õnnestus geen katki teha ja nende kolooniatega töötad edasi.
ehk sinised on need bakterihunnikud kus beeta galaktosidaas veel töötab ja lagundab X-gal-i.

merikuradite laterna sees on bakterid Vibrio harveyi ja nood helendavad seal. helendamise eest vastutab ensüüm nimega lutsiferaas.
mikroobifüsioloogias
minirakkude valgud (MinC MinD MinE) ja nende ülesanded.